圣大陆，圣修塔因王国，王族秘地。
这里原本是修塔因家族花费重金购买下来的土地，但是在席瑞特等人的支持下王国迅速建立，修塔因家族的发展重心转移到别处，修塔因一世就将这片土地分给了从其他地区聚集过来的流民。
但是在四十多年前，这里爆发了一次在当时来看是十分恐怖的兽潮。数百只初阶魔物混杂在上万只猛兽中，由十二只中阶的带领，血洗了八座村庄，与当时刚刚建立的王国军团展开一场为期三个月的血战，在这次事件中死亡人数共计5863人。
为了抚恤灾难的幸存者，修塔因一世亲自率人伐木拓荒，在兽潮爆发的森林中修建了一座名为“守望者”的城市，供幸存者居住，并且组建“守护者”军团专门用以保护居民和对抗周围魔物的侵袭，维持城市秩序。
同时，下达圣修塔因王国至今为止，唯一一项不可更改的法令——除非王国议会全体成员一致同意调动守护者军团，否则守护者军团的军团长有权利无视任何命令（守卫者军团的两任军团长都是由席瑞特训练出来的）。
顺便一提，守卫者军团是目前圣大陆上唯一一支有着四名英雄级将领，掌握特殊军阵，编制在四千人之上的超阶军团。
修塔因一世在安置好幸存者后，重新将土地收回修塔因一族的名下，而后以此为由将国王之位传给库托鲁·修塔因，也就是修塔因二世。
数年后，这里被列为王族秘地之一，每年至少有一支军团和三名高阶职业者在此地镇守，防守人数只可增加，不能减少。
现在这里成为草刺猬谢米的居住地，众多草系宝可梦在这里构建了庞大的生态圈，并且吸引了更多强大的宝可梦在此居住，取代了原来的守卫。
然而，最近秘地中心区域不时爆发的庞大魔力波动，令大量的宝可梦感到不安，这种毁灭性的威能，已经严重影响到它们的生活。
因为它们寻找不到作为首领的谢米，所以妙蛙花首领（极限英雄级）和巨蔓藤首领（极限英雄级）两名在这里颇有名望的宝可梦，前往中心区域询问缘由。
两名首领刚来到中心区域的围墙外，就感觉到剧烈的能量波动，狡猾天狗首领（中等英雄级）在半空躲闪不及，叶子团扇掀起的强风被魔晶重炮洞穿，重重地轰击在他的身上。
浮现在半空的巨大骑士虚影挥舞金色巨剑向着狡猾天狗首领当头劈下，两名首领连忙凝聚草属性能量准备救援。
这时一道黑影从林中窜出，以不可思议的速度飞身来到两者之间，淡黄色的能量屏障升起，不但保护了狡猾天狗首领的安全，而且将金色巨剑的能量尽数吸收，也没有伤害到围墙上的守卫骑士。
狡猾天狗依旧想继续战斗，却被路卡利欧阻止，他使用治愈波动为狡猾天狗首领疗伤，沃登也在此时赶到，怀中还抱着两只橡实果。
他将橡果实放在地上，两只橡果实急忙跑向狡猾天狗首领的身边，由于太过于慌忙，它们被地上的小石块绊了一下，咕噜噜地滚到首领的身旁。
狡猾天狗微微扇动叶子团扇，掀起的微风托起了它们，放入自己的怀中，它就是因为中央区域的魔力波动伤害到自己的族人，才来到这里想要讨个说法。
看着两个孩子的健康的模样，狡猾天狗首领卸去了凶恶的表情，也轻松地笑了起来，在有着梦幻气息的沃登和路卡利欧的劝导下，诸多首领给了他们一个面子，带领着族人回到了各自的领地。
沃登亮出了代表气宗的令牌，金属大门开启，两人进入王国秘地的同时，向空中掷出了一枚洋葱形状的水晶，特殊的能量包裹了整座中心区域包裹，随着空间的一阵扭曲，中心区域凭空消失，只留下一座有着光滑内壁的深坑。
九重炼狱，究极之塔最高层。
九道王座受到莫名力量的感召，在本源力量构成的海洋中浮现，形态各异的阴影出现在王座之上。
明明只是一团团稀薄的阴影，却散发出至高无上的威压，使得波涛汹涌的本源海无法运转，掀起的海浪、散乱的水滴、荡漾的波纹都停滞在阴影出现的这一刻。
几道身影像是超脱了时空的桎梏，无数道影像在现实中演化重叠，却又显示不出阴影的变化。几道阴影无意间散发的气息勾连成一道巨大的漩涡，吞吐着无垠宇宙中万千星辰的光芒。
“亚雷夫世界又出现了一个奇异之人，已经可以宣告“玩偶”的计划失败了，而且这个人的成长能力比精灵女王灵延特还要强大，如果不及时制止，这一次的入侵计划又要全面崩盘，诸位对此有什么想法”。一道威严地在本源海中炸裂开来，无形的力量将一切异象抹除。
“小九的计划失败了，现在还要我们帮你善后吗？这可不是求人的语气，真是个不知羞的孩子”。极具魅惑的女声调笑着最先发言的阴影，空灵的力量激荡起一片迷幻。
“只来了五个人，真是的，早知道这样我也不来了，真是好后悔，好累啊”。浑浊的呻吟声吹起一片白烟，与“迷幻”混杂在一起，遮蔽了本源海。
“现在的年轻人，真不懂得尊老爱幼，弄得这里乌烟瘴气的，有人提出了问题，你们就要回答，对了，刚才你说了什么？”。苍老的声音极具穿透力，仿佛直接刺透了灵魂。
王座末席的阴影没有说话，将自己拉伸成细长的一条，分裂出无数的根须吸收着其他阴影释放的混乱力量。
“你们不要闹了，难道你们还要再体验一次失败的滋味吗？”。威严的声音有了明显的情绪变化，黑色的声波向着四周扩散，让所有的力量走向了终焉。
“真是无理，你似乎忘了这些失败的计划都是你出来的，要不是有老大护着你，你早就被我们吃了”。发出苍老声音的阴影瞬间膨胀，直接用最为野蛮的力量将周围的一切都挤了出去，颇有一种掀桌子的意思。
“有这些力量，不如想想怎么对付阴影宇宙中那些令人作呕的家伙，最近那些东西又侵蚀了一些附属位面，这样下去会很麻烦的”。呻吟的声音变得更加细长，如同哨声的魔音令人“清醒”。
“那些家伙没办法影响到大局，等到我们完全掌握了神的力量，它们根本不值一提。”
“那种真的可以算作“神”吗？离开神明太久，你们已经忘记了敬畏”。苍老的声音瞬间低落下来，庞大的阴影开始坍缩，而后消失在原地，属于它的王座也沉入本源海中。
在这里提到“神明”，触动了它们心中的禁忌，王座如同下饺子般沉入本源海中，会议又一次不欢而散。
黑暗军团，大渊位面。
无数的生灵就像是纸屑般被投入深邃的黑暗中，负责祭祀的“红莲教宗”（传奇七阶）表情虔诚，但是从他裸露皮肤的密集孔洞中挤出的眼珠出卖了它的内心。
眼珠闪烁着一种奇异的神色，那是只有最为疯狂的赌徒才会拥有的表情。
这里是神明遗弃之地，这里曾经让神明流连忘返，可是最后这里却被神明亲手打碎放逐到虚无之中，它们历经了无数的岁月，终于找回了一部分世界碎片。
虽然神明弃之如履的东西，却让他们黑暗军团成为无尽海中的一方霸主，尽管现在它们被阴影宇宙所掌控，但是这并不妨碍它们背弃自己的主人，这又不是第一次了。
深邃的黑暗中露出了一丝金光，深红教宗虔诚的神色瞬间消失不见，取而代之的是无尽的贪婪，但是又流露出一种莫名的惊恐，他的身躯不受控制地一点点朝着金光走去，最后连同自己也一头栽入了黑暗深渊。
黑暗深渊周围专门用来投放祭品的“极巨魔怪”，本就是为了抵抗这种诱惑创造出来的特殊生命体，但是这次也没能逃脱金光的诱惑，炸裂成一团团血雾汇聚到金光之中。
它们可能释放出了无法想象的怪物，而且它们明明知道这里十分危险，却没有派遣重兵把守，可能会导致无法估量的灾祸发生，但它们并不在乎，因为这又不是第一次了。
反抗军基地，这里倒是没有举办什么谋划会议、开启什么秘密项目、进行什么奇怪的仪式，而是直接打了起来。
在与柏莎见面的那一瞬间，马戏之王巴克曼和砰头小丑瞬间投掷出无数把飞刀，将跟随在她身后的两名研究人员瞬间绞杀。
同时两者又揪下了头颅，扔在了通道之中，双重“惊爆大头”顿时爆发，爆炸、火焰、烟雾都被奥蒂斯挡了下来，他有着阻止这一切发生的能力，却没有出手阻止，麻木的脸上首度出现了笑容。