那二十二年里，李天机分析了很多问题，一开始他怀疑黑衣人是他弟弟派来的，毕竟遇害之前他曾经答应过继承皇位，但是经过层层推断，他发现那些黑衣人的武功非常高，基本都是伪掌门级别，他弟弟再怎么有势力，也不可能买通这么多人，这里面透着古怪。
终于，在落谷第二十二年，李天机钓到了一条“无骨金龙”，伤势不仅痊愈，而且二十二年来的专心修炼也一下子让他成为内力极为恐怖的绝世高手，但李天机并不在意这些，他只想知道李虚的下落。
李天机一下子就想到了神卦门，当年与他交好的神卦门传人，早已变成了神卦门门主，李天机根据那位门主曾经告诉过他的方法，找到了神卦门，然而，神卦门门主也无法卜算出李虚的下落，只能知道李虚还活着，李天机只能另想他法。
由于“无骨金龙”只能治疗伤势，却无法治疗二十二年来的营养不足，于是李天机决定在神卦门修养一段时间，等身体完全康复之后再返回洛阳，但是刚修养不到半年，神卦门门主就告诉李天机，李虚出现了，就在杭州，李天机大喜，急忙赶往杭州，但没能碰上。
李天机身上有李虚的“引魂玉”，这是李家为了防止子孙意外流落江湖特意制造的一种玉佩，每个李家子孙出生之后都会立即制作，以血制成，除非更换全身骨血，否则一定可以找到对方，当然前提是需要在一定的范围之内，这也是李天机需要神卦门门主卜算李虚位置的原因。
杭州没有找到李虚，李天机决定返回长安，因为李虚三岁之前，基本都呆在皇宫里，虽然三岁小孩估计根本记不了那么多事，但李虚天资聪颖，说不定可以记起。
李天机查了整整一年，蛛丝马迹找到很多，李虚却了无踪影，但所有的线索，都表明李虚进了皇宫，然后再也没有出来。李天机暗探皇宫数次，依然没能发现任何有用的线索，于是他决定先返回李宅，然而，他看到的却是空无一人的李宅以及李凌的尸体，李天机疚心疾首，他落入桃花谷的时候，李凌刚满十岁，没想到再次相见，却是天人永隔，他看了李凌的遗书，但最终没有埋葬他，李天机打算把皇帝的脑袋带来，让李凌安息。
李天机夜探皇宫，打算杀死李霸先，然而，他发现李霸先进了一间密室，这种密室李天机知道，里面有屏蔽天机的符阵，专门关押一些不便让世人所知的囚犯，李霸先离开密室之后，李天机反倒没有动手，他打算进入密室，看看里面关押的人，密室的打开方式李天机自然知道，捣鼓几下之后，他走进密室，然而刚一进去，他便发现身上的“引魂玉”开始发光——李虚在这里面，李天机又惊又喜。
关押的人确实是李虚，然而，他已经被折磨得没了人样，李天机悲怒交加，二话不说将李虚救出，不过李霸先早已设下机关，一旦李虚逃走，就会发出警告，于是一大堆天干太监开始追杀李天机，李天机担心李虚伤势，只能逃到皇陵二十八层，这里的秘密只有他知道，李天机不信他的父亲会把这个秘密告诉李天机的弟弟。
李虚一开始并没有认出李天机，但李天机非常耐心地跟他讲了所有事情的原委，李虚三岁被抢，但一些记忆还是有的，于是父子相认，李虚也向李天机讲述自己的故事。
原来李虚是被上一代的帝天传人掳走的，至于帝天传人为什么想要掳走李虚，按李虚的估计，是因为他的“武骨”天资，应该是有人密告了帝天传人，帝天传人才会追杀李天机他们，不过他并不知道李虚的身世。
李虚在侠客岛学习、修炼，终于大成，在岛上，他从张百川等人口中得知，吃了“定魄丹”的人，不会再中“魂消魄散”，这让他非常感兴趣，凭他的天资，只要拿到“定魄丹”丹方，李虚有信心可在十年之内研究出不需要“三魂七魄丹”，中毒者甘心被控制的，就连帝天都没能研究出来的“魂消魄散”，“定魄丹”丹方的位置他早就听上一代帝天传人提起过，于是他返回中原，第一站就是皇宫。
然而，进入皇宫的李虚却突然发现，这里他非常熟悉，因为他小时候待过，原来自己跟皇宫大有渊源！于是他悄悄给李霸先下了“魂消魄散”，以图从他口中得知真相，然而，服下“定魄丹”不会再中“魂消魄散”这个现象是李虚自己发现的，帝天和上一代帝天传人都没有发现，所以他们也就没有告诉李虚，皇室成员在出生之后，都会立即服用一颗“定魄丹”，就连李虚自己，也吃过“定魄丹”，所以，李霸先不仅没有中毒，反而知道了李虚的身份，但李霸先谋略深沉，假装中毒听命，然后趁李虚不备偷袭了他——原来李霸先的武功也非常恐怖。
李虚被捉，李霸先开始折磨他，强行给他服下“三魂七魄丹”，然后套出了李虚的所有秘密，李霸先不仅拿到了“魂消魄散”和“三魂七魄丹”的丹方，而且还从李虚那里得知埋藏“魂消魄散”的位置，这批毒药，将近百瓶，数量之多几乎可以控制小半个江湖，不过幸运的是，制作“魂消魄散”需要吃下“禁罡神果”的人的血液，但是距离下一次侠客岛开启还有七年，李霸先也制作不出更多的“魂消魄散”，为了保险起见，他决定收回所有的“定魄丹”丹方，并破坏世间所有的“丹玉神树”，“丹玉神树”有三棵，一棵在冯氏隐世之地，这个只有皇帝才知道位置，不过另外两个地方，即便李霸先也不知道，李虚自然更不清楚，这两棵神树分别在神卦门和神盗门的门派中，是门派的镇派之树，但其实没什么作用，只是历史悠久而已，冯氏隐世之地那棵，还是从神卦门移植的，然而，李霸先不知道从什么地方得知了这两棵树的下落，甚至知道了神卦门和神盗门的秘境入口。
李霸先暗中跟那些中了“魂消魄散”的门派高手交涉，接收上一代帝天传人布置的一切，就在李天机离开神卦门不到一个月之后，李霸先便带着所有被控制的门派高手，进攻神盗门和神卦门，杀光所有的人，毁掉“丹玉神树”……