当时，虽然朱棣登基做了大明的皇帝，但是许多建文朝的老臣对他并不服气。而国内舆论也普遍认为朱棣乃是篡位的贼子，拒绝与朱棣建立的新朝廷合作。
对此永乐帝朱棣虽然非常愤怒，但却也无可奈何。同时，朱棣发动的战争也激发起其他藩王的欲望，而一些手握重兵的将军们也在战争中看清了朝廷的外强中干。即便永乐帝登基即位，可经过几年战争摧残的大明中央朝廷再也无法支撑起一场新的战争了。
所以，当时永乐帝的皇位可以说是岌岌可危。虽然杀一些人可以暂时起到一定的震慑作用，但总不能把所有朝臣都杀死吧？因此当时的永乐帝无法信任各级文武官僚，宫中太监便成为他唯一信任的帮手。
狡猾的永乐帝认为，这些太监向来为朝中文臣武将所不耻，被他们看不起，所以那些文臣武将们肯定不会与太监结党。而太监自打受了宫刑后，违背了“身体发肤受之父母，丝毫不敢有所损伤”的儒家教训，更何况是做了“断子绝孙”的事情，因此便与家庭断了联系，他们自己也便无依无靠。对太监们来说，唯一的依靠就只有皇上了。所以，永乐帝相信，只有太监才是对皇帝最忠诚、最可靠的了。
因此，朱棣登基之后便一反太祖朱元璋和建文帝疏远、打压太监的做法，对太监格外信任，不仅在许多职位上重用太监，而且让太监来监察各级官吏。另外，朱棣还有另外一层不为人知的想法，那就是借助太监的手镇压朝廷中不听话的文臣武将。因为是假以太监之手，即便是受到谴责，也能够将人们的愤怒转移到太监们身上，以此减轻舆论对他自己的压力。
朱棣在刚登基后的几天，与建文旧朝大臣们的斗争十分激烈。当时建文朝廷中部分大臣认为朱棣刚刚登基，天下人还没有真正顺从他，加之京师外围仍有许多忠于建文帝的人正在召集兵马，誓言要进行反攻。所以这些人商量后决定，要趁着朱棣立足未稳的时机，内外合谋，外以勤王大军为要挟，内以京师百姓舆论为工具，逼迫朱棣主动退位。对此朱棣自然十分震怒，但因为敌人的数量众多，要想抵挡这些人的进攻也绝非易事。朱棣苦苦思索，可一时他也没有很好的办法。
甚至还有一次，建文帝的一名旧臣，在早朝的时候竟然试图刺杀朱棣。幸亏此人所携带兵刃被皇宫侍卫发现，朱棣这才躲过一劫。
这场未遂刺杀案彻底惹怒了朱棣。朱棣终于决定不再坐以待毙，他认为必须对建文朝廷的人进行一场彻底的大清洗，彻底消灭这些反对自己的人，真正将朝廷的实权掌握在自己手中。为此他不顾朝野内外的舆论压力，以种种借口大肆处死一批建文朝旧臣。在这个过程中，朱棣对守卫皇宫的侍卫以及大明锦衣卫开始起了疑心，生怕他们不可靠，对自己不利，于是将这些人全部撤换为自己的人。特别是锦衣卫。
永乐帝在做藩王的时候就知道自己的父亲——大明太祖朱元璋，在锦衣卫上颇下了一番功夫。
大明锦衣卫可以说无孔不入。对锦衣卫的能力，朱棣早就心知肚明。但是，这些锦衣卫毕竟是建文朝的旧人，万一其中有人仍然忠于建文帝，要对他行不轨，岂不是易如反掌？
于是他便命令原藩邸护卫郑继之，与另外两人一同组建了新的锦衣卫。为了确保新组建的锦衣卫对自己的绝对忠诚，永乐帝同时任命之前立了大功的太监贾旻担任新组建锦衣卫的提点。郑继之等三人名义上是锦衣卫最高指挥，但实则处处受到贾旻的监视，成为锦衣卫事实上的最高负责人。而贾旻本人却直接听命于永乐帝一人。
贾旻接受任命统领锦衣卫后，一方面按照朱棣的授意对朝廷中心存不服的官员进行了残酷的屠戮震慑；另一方面假借朱棣的皇威，对之前一些与他有过节的人展开了疯狂的报复。这里面首当其冲的便是他的干爹赵老太监等人了。据后来锦衣卫流传下来的说法，贾旻假传圣意，以赵老太监等建文宫中一大批太监“心念建文逆贼，意图勾结卫所造反”等罪名，先后带人血洗了赵老太监等一十五个太监的家。前后被杀太监三百五十余人，其他无辜受牵连者更达到了一千二百余人。
后来，随着永乐帝逐渐坐稳皇位，他施展纵横捭阖的各种手段，陆续镇压各处反抗军队，将不服从自己的地方势力和官员一一打击迫害致死，朝廷内外再也没有人敢公开反对朱棣了。与此同时，朱棣上台之后也确实实施了一系列安抚百姓的政策。比如，通过减免战争区老百姓的赋税等形式收买人心。人们也不想再有战争，渴望过上太平日子，所以朱棣的皇位越坐越稳，以至于出现了所谓的太平盛世。
贾旻则在永乐帝排除异己的过程中，充当了急先锋和工具的作用。他杀害无数忠良，一时间他的名号使人闻之色变。贾旻十分善于揣摩朱棣的心思，一旦有人表现出对朱棣的不忠，不需要朱棣说什么话，他早就命令锦衣卫将那人除掉了。
不但如此，他从自己的切身经验中悟出一个道理，那就是“斩草不除根，春风吹又生”。他认为除掉一个人，就必须将那个人，以及和他有联系的所有人都除的干干净净，以免留下后患。所以，一旦落入他的手中，必定要将那人杀死，并且一定要将其满门抄斩方才罢手。哪怕是一些永乐帝示意他给点小教训的人，他也一定要将那人杀死。贾旻深知一旦这些遭受自己迫害的人将来翻了身，他贾旻也将死无葬身之地了。因此，他常常因为“错会圣意”而“误杀”许多人。对此朱棣虽然心知肚明，倒也没有过多苛责贾旻。就是因为贾旻如此的心狠手辣，最后渐渐被人们都称为“鬼见愁”！
半年后，当永乐帝感觉天下已经太平，自己的皇位彻底稳定，已经再没有什么人能够威胁自己了，他也开始意识到贾旻的权力过大。贾旻牢牢掌握着锦衣卫，这让永乐帝非常不放心。为了压制贾旻，于是永乐帝便将锦衣卫分为分为天、地、日、月、星、辰等几卫。其中最精锐的天字卫单独成为一部分，直属于永乐帝，直接听命于皇帝本人，任何人都不得插手干预。其余几卫方才由贾旻掌握。但他名义上仍然是整个锦衣卫的提点太监。又过了一些时日，永乐帝彻底免了贾旻锦衣卫提点的职务，让他重回内宫，负责内宫安保。再后来，大概是五年前，永乐帝彻底将贾旻踢出皇宫，让他在家养老。
最近几年，随着锦衣卫在大明权力制度内越来越重要的作用，永乐帝又对锦衣卫体制进行了改革。永乐帝任命皇太孙为锦衣卫总管，但另派太监袁炳担任锦衣卫提点。使他们互相监督制衡。
这几年虽然贾旻的势力已经大不如前了，但永乐帝也没有完全忘记他在靖难之役，以及在巩固皇位过程中立下的汗马功劳。更重要的是，永乐帝也知道贾旻对他是忠心耿耿的。因此，平日里照样给他以优厚的待遇和荣誉。
另外，大臣们都知道贾旻虽然在家养老，但其实还担负着监视朝臣的任务。据可靠传言，贾旻会不定期将侦听到的朝臣们的小报告送给永乐帝。因此他虽然告老在家，许多人仍旧对他趋之若鹜。
现在贾旻惨死在自己的府中，而且身首异处，永乐帝认为这是有人在向他挑衅，自然十分愤怒。加之永乐帝身边的一帮太监们物伤其类，一致请求永乐帝一定要捉拿杀人凶手，并处以极刑。所以永乐帝传旨皇太孙，要其务必限期将杀人凶犯捉拿归案。