木叶之根失联，志村团藏生死不明，闯入千手庄园的阿斯玛也，也疯了……
不等进退失据的三代火影等人理清头绪，随着传奇间谍药师野乃宇秘密归来，木叶进入全新格局。
得知照片真相的药师野乃宇恨不得将志村团藏千刀万剐，果断投身千手庄园，一夜过后，正式入主木叶根部。
由于舌祸根绝之印，猿飞日斩等人对于木叶之根内部变故自是一无所知。
在药师野乃宇那真真假假说辞下，真相变成志村团藏在即将以根部大本营为代价，将直树封绝的关键时刻，其身上由柱间细胞制造出来的木遁右臂造反，最终导致功亏一篑。
根部忍者在名义上已然易主，目前组织由团藏长老进入保命封印前，发令紧急调回的自己代理。
在团藏长老恢复之前，木叶之根由药师野乃宇当家作主，
而药师野乃宇也不负其传奇之名，在前来火影办公室之前，昨夜就进入千手庄园，与直树深入交流过。
在药师野乃宇的一番口舌之下，直树已经被一旦木叶之根失去震慑力，火之国将会永无宁日这一观点睡服。
按药师野乃宇话中之意，自身能力有限、木叶之根维持境外安稳已是勉力撑持。
再加上木叶根部名义上又已经投向千手怀抱，所以在团藏长老恢复之前，不方便参与村子内部的事务。
木叶F4余下的日斩、小春、门炎三人可说是喜出望外。
什么叫惊喜，这TMD就是惊喜，大惊喜！
虽然失去了木叶之根这份助力，但是相比志村团藏对于木叶内部的指手划脚，猿飞日斩等三人早就到达忍耐边缘了。
但是木叶村对外，可缺不得木叶之根的暗黑震慑，真以为第一忍村之名是打赢了忍界大战就可以一劳永逸的。
没有木叶之根对外的无休止兼无下限的暗杀追杀、搞政变搞破坏颜色革命，木叶村根本不可能有安稳的外部环境。
志村团藏对外的黑锅同样不少，比如说弥彦，正是弥彦之死，导致了长门的黑化、晓组织的转变。
但是志村团藏的对外贡献更大，比如说最为典型的汤之国。
众所周知，汤之国在漩涡鸣人那一代，甚至就连忍者也在汤之国大名削减经费下消失，在大力发展的温泉旅游下，几成忘却战争的天国。
但是年轻一辈不知道的是，曾被称作“战斗忍村”的汤忍村，也曾是一度有望成为第六忍村的大忍村，却因为身处雷火交界之故，被志村团藏给盯上了。
云忍村的忍者素质并不木叶村之下，仅是因为人口之故，整体实力才会屈居木叶一头。
一旦被云忍吞并了周边小国，那么云忍村的战争潜力将不在木叶之下，而第一忍村木叶村每逢忍界大战，往往是以一打四。
所以志村团藏出手了，木叶之根前赴后继，在根忍生生不绝的打击下，战斗忍村活生生被打断了脊梁，不得不放弃忍村事业转为大力发展旅游业。
如果不是国内的自然环境以及温泉资源，汤忍就活生生饿死了，如果不是没有办法，汤忍村何必放弃忍者路线，
这是不得不为也，先是武装派，后来但凡有点气血、有点实力、甚至有点潜力的，统统倒在木叶之根的屠刀之下。
不是汤忍村爱好和平，而是不和平者、全都被和谐了，不是汤之国忘却战争，而是不得不忘却战争！
至此，失去战争潜力的汤之国，其漫长的国境线就成为了雷火两国最好的缓冲地带。
而云忍村的战争潜力，就此被志村团藏给生生扼断，忍之暗的阴影也自此笼罩着忍界。
这才是志村团藏被撸、被解除职务，仍然可以对村子品头论足指手划脚的核心原因，木叶村对外、只有志村团藏有那个震慑力。
而木叶之根再怎么无下限，也是木叶这棵大树必不可少的根须。
现在木叶根部由药师野乃宇当家作主，其竟然只对外运作，而不插足村子内务这块。
外部仍然安稳，内部从此没有人说长道短、指手划脚。你说，猿飞日斩三人能不惊喜、喜出望外么。
药师野乃宇没有想到，三代火影、火影顾问等三人竟然这般轻易地，就相信了自己的说辞，有种昨夜的付出血亏之感。
木叶高层就这，就这!
这就般被权势腐浊的看不清，这样的老不死、对得起千千万万在外为村子出生入死的无名英雄么……
一念之间，身体已被收取的药师野乃宇，心也彻底偏向直树。
药师野乃宇既能干又能干，所以补全了情报组织这一块耳目的直树，这两年过得可滋润了，所有能够想到的花样都透了。
卯月夕颜、夕日红这两朵金花逃无可逃，先后被拿下。
内八门迟迟得不到提升的美奈太太，用为日向崛起而不得不为说服了自己，也在顺手推舟下被水到渠成，那美琴都不具有的名门气质嘿嘿。
完全变成了直树形状的美琴夫人，也给了直树一个大大的惊喜。
活泼、活性，查克拉活性，查克拉活性化，查克拉活化！
查克拉带来的细胞活性化在火影中有频繁的出现，有些忍术的本质就是所谓的活性化，比如说木遁、仙人模式、医疗忍术、倍化术、雷遁铠甲等：
纵所周知，下忍到中忍，是查克拉积储。
只要脑子没问题，三五年的下忍生涯之后，一般的下忍经验如此丰富的情况下评个中忍不难。
但是中忍到上忍，可就是质的提升。
因为想要成为正经上忍，你必须学会查克拉性质变化。
性质变化即是将两种或两种以上的将查克拉属性进入融合变化。
两种性质变化，即为血继界限的前置，三种性质变化以上，即为血继淘汰的前摇。
而精通两种以上查克拉的性质变化，就是上忍了。
这也是血继界限大行其道，忍族地位天然高于平民忍者的主要原因，忍族专出“高手”。