阿尔克墨涅即将剩下宙斯的儿子，就在他降生这一天，宙斯在巍峨的奥林匹斯山上对众神宣布，这儿子是一位伟大的英雄，将统治他的所有亲人，即珀耳修斯的后代。***
宙斯的妻子赫拉对凡人阿尔克墨涅成为宙斯的人非常痛恨，也就同时恨上了阿尔克墨涅的儿子赫拉克勒斯。赫拉悄悄在心中定下计策，令司欺骗的女神阿忒控制住宙斯的理智，骗他下不可违背的誓：今天，珀耳修斯家族最先出生的孩子将成为所有亲属的统治者。
然后，赫拉立即坐上金马车驰离光明的奥林匹斯山，来到阿耳戈斯，促使斯忒涅罗斯——珀耳修斯之子斯忒涅罗斯那像女神一样美丽的妻子，提前产下病弱的欧律斯透斯。随后，赫拉有匆匆赶回奥林匹斯山，告诉伟大的乌云聚散者宙斯，斯忒涅罗斯的儿子欧律斯透斯在阿耳戈斯诞生了。由于他是今天第一个出生的婴儿，就应该统治所有珀耳修斯的后代。
伟大的宙斯这时才知道赫拉所干的勾当。司欺骗女神阿忒蒙住他的理智，因此宙斯大怒。揪住阿忒的头，把她扔下了奥林匹斯山，让她一直生活在人间，不准再回奥林匹斯山。
为改善赫拉克勒斯的命运，宙斯与赫拉订下不可违反的协议：他的儿子不会终生被欧律斯透斯统治，只需帮欧律斯透斯建立十二件伟大的功绩，就可恢复自由，而且获得永生。为帮助自己的儿子克服艰险，宙斯派自己心爱的女儿雅典娜前去帮忙。此后，没当看到赫拉克勒斯在为胆小无能的欧律斯透斯效力时承受巨大艰辛之时，他都悲伤不已，却又不能违背誓。
但赫拉从未放弃谋害赫拉克勒斯。还在赫拉克勒斯出生时，她就派出两条毒蛇，前去杀害新生的英雄。在一个万籁俱寂的深夜，两条毒蛇悄悄爬到婴儿的摇篮旁，双眼闪着凶光，想去将幼小的赫拉克勒斯缠住，以便把他勒死，赫拉克勒斯突然惊叫着醒了。他初试了神力，一抓住一条蛇的七寸，阿尔克墨涅听见叫声从床上跳了起来，王宫中的贵族和女佣也涌进卧室。他们看到摇篮中的蛇，一个个高声惊叫，但这时，赫拉克勒斯已将两条蛇扼死了。阿尔克墨涅的丈夫，底比斯国王安菲特律翁对自己养子的力量大感震惊，赶忙请来祭祀忒瑞西阿斯。这个能预见未来的盲老头说，赫拉克勒斯将建立无数伟大的功绩，在生命结束时将获得永生，并预，他将永享青春女神赫伯的爱。
当安菲特律翁得知阿尔克墨涅所生的这个儿子将获得巨大的光荣，便开始对赫拉克勒斯施以英雄应有的教育。不仅注重对赫拉克勒斯体力的展，也注重对他智力的培养。他请来各路英雄教他读书、写字、唱歌、弹琴。尽管赫拉克勒斯显示出惊人的才能，但在知识和音乐方面的成绩远远比不上在摔跤、射箭、击剑和战斗等方面的成绩。他的音乐教师——俄耳甫斯的兄弟利诺斯，由于缺乏耐心，常常和这位学生生气，有时甚至会严厉的处罚赫拉克勒斯。有一次，因为赫拉克勒斯不愿学习，利诺斯气得打了他。赫拉克勒斯顺手抓起齐特尔琴朝利诺斯的脑袋上打去。但赫拉克勒斯没有料到这一下的力量竟如此之大，利诺斯立即倒地身亡了。赫拉克勒斯因杀人罪被传唤到法庭。最公正的法官拉达曼堤斯判决他自卫还手，免受处罚。
但他的养父安菲特律翁担心他日后再犯类似事件，便把他送到喀泰戎山茂密的森林中，和牛群一起生活。
赫拉克勒斯在忒拜
在喀泰戎山的森林中，赫拉克勒斯一天天长成了强壮的小伙子。他比别人高出一头，体力更是常人难以匹及。第一眼就能看出他是宙斯的儿子，特别是那双眼睛，闪耀出一种异乎寻常的神之光芒。在实战中，赫拉克勒斯显示了无人可比的机警灵巧，他射箭和投掷长抢的精湛技术更是为他建立了卓越功勋。早在青少年时，他曾偶然遇上出没于山巅的凶猛的喀泰戎狮子。他将狮子射死，又剥下狮皮制作了一件盔甲，穿在身上，用狮制成头盔。他还曾涅墨亚树林里将一棵木质坚硬似铁的楞树连根拔起，做成又长又粗的大棒槌。他还受到众神的礼物，包括：赫耳墨斯的利剑，阿波罗送的弓箭，赫菲斯托斯特制的金铠甲，雅典娜亲自织就的衣衫。